102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4322 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  100 
 
 		 611 aa  1246    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  38.88 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  39.63 
 
 		 616 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  36.7 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  35.18 
 
 		 614 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  36.45 
 
 		 622 aa  342  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  37.16 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  36.39 
 
 		 635 aa  337  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.71 
 
 		 618 aa  335  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  34.81 
 
 		 605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.85 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  35.09 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  33.12 
 
 		 657 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  33.44 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  35.06 
 
 		 606 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  35.21 
 
 		 615 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  34.25 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.94 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.34 
 
 		 592 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.94 
 
 		 592 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  33.28 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  31.91 
 
 		 650 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  33.06 
 
 		 640 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.83 
 
 		 652 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  34.38 
 
 		 647 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  32.66 
 
 		 640 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  31.37 
 
 		 642 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  33.22 
 
 		 610 aa  291  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  32.27 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.23 
 
 		 683 aa  286  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  33.11 
 
 		 635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  33.84 
 
 		 612 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.23 
 
 		 647 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  32.41 
 
 		 690 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  34.99 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  30.76 
 
 		 644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  31.82 
 
 		 673 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  31.04 
 
 		 673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  31.04 
 
 		 673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  30.53 
 
 		 694 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  33.17 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  35.24 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.38 
 
 		 558 aa  257  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  31.88 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.92 
 
 		 679 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  35.93 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  30.83 
 
 		 612 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  35.28 
 
 		 535 aa  244  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  32.73 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  29.33 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  35.71 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  36.03 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  31.9 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  34.6 
 
 		 427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  35.08 
 
 		 416 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  33.97 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  27.32 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  34.06 
 
 		 417 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  33.49 
 
 		 417 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  31.4 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.09 
 
 		 555 aa  164  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.57 
 
 		 685 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.64 
 
 		 554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.45 
 
 		 540 aa  114  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  28.12 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.83 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  28.1 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.13 
 
 		 514 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.81 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.12 
 
 		 530 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.81 
 
 		 639 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.11 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.82 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.23 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.5 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  47.06 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.04 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  34.78 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  40 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.91 
 
 		 372 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  31.76 
 
 		 434 aa  51.2  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.78 
 
 		 407 aa  51.2  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.23 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.03 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 558 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 564 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.88 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.24 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  42.65 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.24 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.88 
 
 		 407 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  32.26 
 
 		 122 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  31.65 
 
 		 589 aa  44.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.57 
 
 		 752 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 		 408 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>