138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1042 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  100 
 
 		 612 aa  1242    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  40.86 
 
 		 618 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  38.59 
 
 		 608 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  36.09 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  38.51 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  38.03 
 
 		 616 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  35.86 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  35.73 
 
 		 642 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  35.19 
 
 		 635 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  35.27 
 
 		 614 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  35.21 
 
 		 627 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  36.28 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.7 
 
 		 821 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  37.85 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  34.87 
 
 		 638 aa  349  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  35.21 
 
 		 673 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  35.16 
 
 		 673 aa  347  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  35.05 
 
 		 673 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  34.57 
 
 		 640 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  35.94 
 
 		 690 aa  343  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  34.56 
 
 		 694 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  35.15 
 
 		 650 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  33.97 
 
 		 640 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  33.97 
 
 		 640 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  33.66 
 
 		 640 aa  339  9e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  34.63 
 
 		 612 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  34.52 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.28 
 
 		 652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  34.35 
 
 		 630 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  33.94 
 
 		 605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  33.85 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  32.96 
 
 		 644 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  33.17 
 
 		 606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  37.37 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.82 
 
 		 570 aa  319  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  34.17 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  32.3 
 
 		 683 aa  316  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  33.4 
 
 		 529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  33.06 
 
 		 610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.61 
 
 		 615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.49 
 
 		 592 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  31.28 
 
 		 592 aa  310  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  33.9 
 
 		 627 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.32 
 
 		 592 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.93 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  33.33 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  32.42 
 
 		 615 aa  286  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  33.41 
 
 		 535 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  32.24 
 
 		 537 aa  276  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  32.15 
 
 		 612 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.19 
 
 		 549 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  32.02 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  32.6 
 
 		 539 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  32.78 
 
 		 538 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  32.22 
 
 		 426 aa  210  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.86 
 
 		 416 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  32.46 
 
 		 427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.82 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.12 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  29.79 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.54 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  27.49 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25 
 
 		 685 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.13 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  26.79 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  28.24 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.91 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.34 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.67 
 
 		 554 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  24.41 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.74 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.94 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.69 
 
 		 639 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.89 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  26.87 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  38.82 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  42.68 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  38.38 
 
 		 101 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.94 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 561 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  37.37 
 
 		 101 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  37.37 
 
 		 101 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  39.53 
 
 		 92 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  36.9 
 
 		 572 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 		 572 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.94 
 
 		 411 aa  53.9  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 		 574 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  39.42 
 
 		 119 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  36.36 
 
 		 101 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  31.87 
 
 		 104 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  43.55 
 
 		 586 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.73 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  39.08 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.76 
 
 		 575 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 		 575 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.05 
 
 		 571 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  30.39 
 
 		 205 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>