130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1370 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  69.49 
 
 
540 aa  763    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
540 aa  1108    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  45.35 
 
 
541 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  44.92 
 
 
539 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  45.44 
 
 
530 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.68 
 
 
535 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  27.03 
 
 
630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  26.84 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  25.75 
 
 
539 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  28.02 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  26.7 
 
 
657 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  26.39 
 
 
598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  27.45 
 
 
640 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  25 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  26.45 
 
 
611 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  26.72 
 
 
640 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  26.72 
 
 
640 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  27.11 
 
 
618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  25.23 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  25.71 
 
 
581 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  28.47 
 
 
608 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  26.67 
 
 
650 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  25.17 
 
 
821 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  26.71 
 
 
615 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  25.46 
 
 
622 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  24.72 
 
 
652 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  25.33 
 
 
614 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  24.44 
 
 
638 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  24.15 
 
 
538 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  25.34 
 
 
612 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  24.18 
 
 
647 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  26 
 
 
635 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  25 
 
 
606 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  25.65 
 
 
555 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  27.12 
 
 
535 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  25.71 
 
 
512 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  29.34 
 
 
647 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  27.23 
 
 
424 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  26.1 
 
 
616 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  24.37 
 
 
605 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  25.23 
 
 
612 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  24.47 
 
 
537 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  23.65 
 
 
529 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  26 
 
 
627 aa  93.6  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  23.28 
 
 
635 aa  90.9  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  23.37 
 
 
558 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  25.72 
 
 
416 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  25.62 
 
 
673 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  25.17 
 
 
615 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  25.37 
 
 
426 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  25 
 
 
673 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  24.41 
 
 
644 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  25.17 
 
 
673 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  24.38 
 
 
499 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  25.59 
 
 
521 aa  87  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  25.69 
 
 
694 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  26.21 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  23.93 
 
 
683 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  25.56 
 
 
679 aa  83.6  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  25.94 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  24.02 
 
 
642 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  25.12 
 
 
690 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  22.47 
 
 
627 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  23.27 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  23.49 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  22.81 
 
 
592 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  27.88 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.95 
 
 
685 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  23.68 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  25.81 
 
 
417 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.26 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  23.44 
 
 
534 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.09 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  20.87 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
153 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
153 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.15 
 
 
153 aa  50.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.15 
 
 
153 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
176 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2065  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 
300 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
153 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.68 
 
 
170 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.39 
 
 
141 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  34.62 
 
 
140 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 
132 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.78 
 
 
167 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 
81 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
169 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.76 
 
 
149 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  35.59 
 
 
81 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.43 
 
 
144 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.27 
 
 
58 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 
156 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
378 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  35.14 
 
 
292 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 
264 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>