74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1485 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 537 aa  1084    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  43.39 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  39.36 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  43.23 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  41.5 
 
 		 622 aa  361  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  44.31 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  38.28 
 
 		 638 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  40.48 
 
 		 635 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  38.37 
 
 		 635 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  36.67 
 
 		 647 aa  343  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  35.92 
 
 		 627 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  38.15 
 
 		 642 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  39 
 
 		 657 aa  340  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  36.45 
 
 		 644 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  35.11 
 
 		 652 aa  327  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  34.52 
 
 		 650 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  38.45 
 
 		 630 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  33.53 
 
 		 640 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.94 
 
 		 618 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  34.42 
 
 		 614 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 640 aa  287  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.24 
 
 		 612 aa  276  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  32.93 
 
 		 608 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.86 
 
 		 612 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.8 
 
 		 616 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  34.15 
 
 		 605 aa  253  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  36.85 
 
 		 627 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  31.42 
 
 		 673 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.45 
 
 		 647 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  31.24 
 
 		 673 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  35.78 
 
 		 615 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  32.73 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  35.02 
 
 		 615 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.39 
 
 		 821 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.96 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.26 
 
 		 690 aa  233  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  34.35 
 
 		 610 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.61 
 
 		 570 aa  229  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  34.28 
 
 		 549 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  32.76 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.12 
 
 		 592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.12 
 
 		 592 aa  220  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  33.83 
 
 		 612 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  30.3 
 
 		 592 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  29.9 
 
 		 673 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.06 
 
 		 683 aa  213  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.7 
 
 		 679 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  32.2 
 
 		 558 aa  210  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.74 
 
 		 694 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  32.07 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  30.23 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  32.03 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  30.41 
 
 		 538 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  28.88 
 
 		 417 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  28.88 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  29.07 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  31.75 
 
 		 416 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  27.71 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.71 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  28.09 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  28.18 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  28.74 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.47 
 
 		 540 aa  94.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.65 
 
 		 685 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.66 
 
 		 554 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.53 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.23 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  23.37 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.6 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.5 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.44 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  21.97 
 
 		 540 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>