74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3459 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  100 
 
 		 417 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  95.2 
 
 		 417 aa  776    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  57.11 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  57.48 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  57.73 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  52.31 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  42.51 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  34.74 
 
 		 610 aa  229  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  33.64 
 
 		 615 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.39 
 
 		 614 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.22 
 
 		 592 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.22 
 
 		 592 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  37.79 
 
 		 612 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.66 
 
 		 608 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.81 
 
 		 821 aa  210  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.14 
 
 		 592 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  33 
 
 		 570 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  32.13 
 
 		 598 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.75 
 
 		 652 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  33.33 
 
 		 581 aa  203  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.73 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.84 
 
 		 650 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.41 
 
 		 605 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.5 
 
 		 558 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  32.05 
 
 		 657 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  34.06 
 
 		 611 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  30.35 
 
 		 644 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.62 
 
 		 616 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  30.63 
 
 		 635 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  30.12 
 
 		 612 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  33.18 
 
 		 673 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  33.93 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.13 
 
 		 647 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  30.68 
 
 		 606 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  33.65 
 
 		 622 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  30.26 
 
 		 647 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  31.49 
 
 		 690 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  33.33 
 
 		 673 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  32.13 
 
 		 618 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  28.92 
 
 		 535 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  29.93 
 
 		 638 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  32.12 
 
 		 694 aa  173  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  27.86 
 
 		 627 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  32.36 
 
 		 612 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  31.6 
 
 		 549 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  30.7 
 
 		 538 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  31.86 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  28.4 
 
 		 642 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  31.69 
 
 		 630 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  28.88 
 
 		 537 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  28.43 
 
 		 640 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  32.62 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  28.21 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  31.21 
 
 		 615 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  32.19 
 
 		 679 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  27.38 
 
 		 635 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 		 640 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 		 640 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  30.38 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  28.94 
 
 		 683 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  31.23 
 
 		 640 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  28.5 
 
 		 521 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  30.77 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.48 
 
 		 685 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.16 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  29.83 
 
 		 499 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  31.92 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.86 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  27 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.84 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.06 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.02 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.32 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  24.53 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>