74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1141 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  100 
 
 
512 aa  1021    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  48.42 
 
 
529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  45.17 
 
 
535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  43.23 
 
 
537 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  40.31 
 
 
657 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  43 
 
 
622 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  38.57 
 
 
652 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  38.67 
 
 
627 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  38.42 
 
 
638 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  39.53 
 
 
642 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  40.16 
 
 
521 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  39.04 
 
 
635 aa  359  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  40.98 
 
 
630 aa  358  9e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  37.13 
 
 
650 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  40.95 
 
 
635 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  38.79 
 
 
644 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  37.37 
 
 
612 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  34.43 
 
 
647 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
640 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
640 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
640 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  34.3 
 
 
640 aa  323  5e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  39.92 
 
 
618 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  38.07 
 
 
615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  35.11 
 
 
614 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  36.59 
 
 
627 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  34.26 
 
 
616 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  34.58 
 
 
647 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  33.27 
 
 
608 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.24 
 
 
611 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.84 
 
 
821 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  34.63 
 
 
615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  34.15 
 
 
598 aa  266  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  32.17 
 
 
673 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  31.71 
 
 
673 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.87 
 
 
690 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  36.6 
 
 
558 aa  259  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  31.18 
 
 
673 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  31.47 
 
 
694 aa  256  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  34.38 
 
 
683 aa  256  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  34.55 
 
 
610 aa  250  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  36.88 
 
 
581 aa  247  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.39 
 
 
570 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.46 
 
 
605 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  37.65 
 
 
549 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  31.35 
 
 
679 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.24 
 
 
592 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  32.48 
 
 
592 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.01 
 
 
612 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  36.49 
 
 
612 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  30.84 
 
 
592 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  33.41 
 
 
606 aa  223  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.09 
 
 
539 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  33.33 
 
 
538 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  32.71 
 
 
426 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.39 
 
 
417 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  31.5 
 
 
424 aa  170  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.62 
 
 
417 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  29.38 
 
 
427 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  31.07 
 
 
416 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  33.25 
 
 
555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.52 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.71 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  29.03 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.21 
 
 
540 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  27 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  28.06 
 
 
499 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.51 
 
 
554 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.54 
 
 
685 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  25.46 
 
 
539 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  27.11 
 
 
514 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.23 
 
 
535 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.13 
 
 
530 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27 
 
 
639 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>