214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0797 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  100 
 
 		 657 aa  1340    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  42.55 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  41.23 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  40.99 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  39.91 
 
 		 627 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  42.66 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  39.7 
 
 		 652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  40.85 
 
 		 650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  39.47 
 
 		 647 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  40.37 
 
 		 635 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  40.28 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  39.45 
 
 		 642 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 640 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 640 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  41.86 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  38.65 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  36.09 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35.26 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.49 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  35.59 
 
 		 614 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  40.31 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  37.28 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  36.17 
 
 		 615 aa  365  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.29 
 
 		 821 aa  359  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  33.93 
 
 		 615 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.49 
 
 		 608 aa  350  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  36.31 
 
 		 627 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 		 537 aa  340  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  34.05 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  33.13 
 
 		 612 aa  323  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  33.12 
 
 		 611 aa  319  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.74 
 
 		 647 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  32.5 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  31.82 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.48 
 
 		 605 aa  301  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  30.37 
 
 		 673 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  30.37 
 
 		 673 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  31.33 
 
 		 592 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.18 
 
 		 673 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.04 
 
 		 570 aa  291  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.8 
 
 		 694 aa  291  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  32.08 
 
 		 610 aa  290  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  32.37 
 
 		 606 aa  280  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  29.26 
 
 		 690 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.04 
 
 		 679 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.12 
 
 		 683 aa  272  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.49 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  32.9 
 
 		 612 aa  262  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  34.76 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  33.73 
 
 		 549 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.97 
 
 		 539 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  33.56 
 
 		 426 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  32.39 
 
 		 427 aa  197  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.33 
 
 		 417 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.05 
 
 		 417 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  31.19 
 
 		 538 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.07 
 
 		 424 aa  177  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  29.33 
 
 		 416 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  31.88 
 
 		 410 aa  163  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  31.11 
 
 		 555 aa  154  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  30.5 
 
 		 499 aa  124  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.7 
 
 		 540 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.93 
 
 		 534 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.59 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.07 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.99 
 
 		 530 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.72 
 
 		 685 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.63 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.65 
 
 		 539 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  25.46 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.41 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.33 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  34.34 
 
 		 104 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.74 
 
 		 354 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 		 341 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2960  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.38 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  33.07 
 
 		 352 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.07 
 
 		 333 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3214  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.17 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  32.26 
 
 		 101 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  38.78 
 
 		 353 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.47 
 
 		 364 aa  50.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.94 
 
 		 365 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  32.89 
 
 		 369 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.65 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.89 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  31.18 
 
 		 101 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  36.27 
 
 		 99 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  30.59 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.21 
 
 		 328 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  36.27 
 
 		 99 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  32.26 
 
 		 101 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  36.27 
 
 		 99 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.27 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.58 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.57 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  39.06 
 
 		 106 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>