More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0623 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  100 
 
 
101 aa  203  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  99.01 
 
 
101 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  98.02 
 
 
101 aa  201  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  79.21 
 
 
101 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  50.5 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.51 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  47.62 
 
 
113 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 
112 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  49.47 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.44 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  46.67 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  45.45 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.44 
 
 
112 aa  90.5  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  43.81 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.71 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  43.43 
 
 
112 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  45.54 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.43 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  45.71 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  43.43 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.71 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.71 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
113 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
112 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.45 
 
 
111 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.43 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.43 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.42 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.43 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.56 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.41 
 
 
112 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.43 
 
 
113 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
112 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.42 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  43.43 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  44.21 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  41.9 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.9 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.44 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.9 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  41.9 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.9 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  39.18 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  42.42 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  45.28 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  43.81 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.26 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.76 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  40.43 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  39.36 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  41.9 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  40.62 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.81 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  39.6 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  42 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.76 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  42 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  41.84 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.6 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  42 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>