74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1265 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  100 
 
 		 535 aa  1096    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  55.24 
 
 		 529 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  45.17 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  37.28 
 
 		 657 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  38.85 
 
 		 627 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  44.31 
 
 		 537 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  39.2 
 
 		 638 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  36.02 
 
 		 647 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  38.12 
 
 		 635 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  41.26 
 
 		 622 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  38.17 
 
 		 644 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  36.46 
 
 		 521 aa  345  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  36.81 
 
 		 635 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  36.87 
 
 		 630 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  36.69 
 
 		 652 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  41.04 
 
 		 642 aa  336  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  35.67 
 
 		 650 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  35.01 
 
 		 640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  35.4 
 
 		 640 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  35.4 
 
 		 640 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  37.09 
 
 		 627 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  34.17 
 
 		 640 aa  299  9e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  35.58 
 
 		 610 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.5 
 
 		 614 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  33.92 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  36.71 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.41 
 
 		 612 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  37.09 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  35.85 
 
 		 608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  36.02 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  39.59 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  31.95 
 
 		 821 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  38.99 
 
 		 605 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  36.63 
 
 		 592 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  36.5 
 
 		 592 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  30.1 
 
 		 618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  29.86 
 
 		 690 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  30.8 
 
 		 647 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  36.25 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.05 
 
 		 612 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  36.77 
 
 		 549 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  30.35 
 
 		 673 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  30.35 
 
 		 673 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.28 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.33 
 
 		 673 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  33.49 
 
 		 558 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  35.45 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.94 
 
 		 683 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.85 
 
 		 606 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.25 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  27.85 
 
 		 694 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.36 
 
 		 679 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  34.93 
 
 		 612 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  29.66 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  28.92 
 
 		 417 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  29.77 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  28.07 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  29.53 
 
 		 416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  28.38 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  27.68 
 
 		 555 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  28.33 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  27.71 
 
 		 410 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  27.49 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  25.67 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.99 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  30.19 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.45 
 
 		 685 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.12 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  23.75 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  29.5 
 
 		 541 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  22.91 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  26.39 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.7 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.22 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>