111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0672 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1108    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  66.04 
 
 		 539 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  61.31 
 
 		 535 aa  672    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.35 
 
 		 540 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  47.3 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  44.57 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  26.36 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  26.83 
 
 		 635 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  25.66 
 
 		 614 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  26.48 
 
 		 821 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  26.01 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  27.64 
 
 		 581 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  26.59 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  26.67 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  23.78 
 
 		 652 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  25.81 
 
 		 618 aa  104  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  24.3 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  27.55 
 
 		 630 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  24.53 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  25.92 
 
 		 616 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  26.15 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  27.42 
 
 		 558 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.5 
 
 		 538 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  25.98 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  24.47 
 
 		 694 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  23.74 
 
 		 644 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  25.45 
 
 		 638 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  24.57 
 
 		 640 aa  97.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  25.23 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  25.64 
 
 		 592 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  25.81 
 
 		 611 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  26.96 
 
 		 605 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  25.19 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  26.19 
 
 		 615 aa  95.1  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  26.62 
 
 		 642 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  24.15 
 
 		 647 aa  93.6  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  24.89 
 
 		 592 aa  93.6  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  25.63 
 
 		 640 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  25.63 
 
 		 640 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  25.23 
 
 		 612 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  23.45 
 
 		 610 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  25.11 
 
 		 592 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  24.42 
 
 		 622 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  27 
 
 		 512 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  24.63 
 
 		 690 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  24.41 
 
 		 612 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  29.5 
 
 		 535 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  25.53 
 
 		 647 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  24.94 
 
 		 635 aa  84.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  26.28 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  26.15 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.34 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  24.94 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  24.68 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  21.76 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  23.37 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  25.58 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  24.28 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  25.44 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  23.57 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  25.09 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  25.81 
 
 		 612 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  23.57 
 
 		 673 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  24.52 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  26.61 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  25.94 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  24.13 
 
 		 679 aa  64.3  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.15 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  22.34 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.33 
 
 		 685 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  22.88 
 
 		 514 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  23.26 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  24.08 
 
 		 417 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  23.58 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.06 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1518  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 132 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  36 
 
 		 614 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13680  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  38.71 
 
 		 235 aa  47.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 1013 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.43 
 
 		 206 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  27.54 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 152 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.541744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16810  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  36.07 
 
 		 174 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3200  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.48 
 
 		 763 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.67 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1907  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.31 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2903  NrfC, Fe-S-cluster-containing hydrogenase component 1  45.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.567692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3157  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02120  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  39.19 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1286  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  31.65 
 
 		 738 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.499406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2795  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 333 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.3 
 
 		 369 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.48 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  45.65 
 
 		 289 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 132 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 162 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  36.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>