81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1835 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  100 
 
 
639 aa  1246    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  39.39 
 
 
534 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.34 
 
 
554 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.19 
 
 
685 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  33.01 
 
 
499 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  32.42 
 
 
514 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  23.04 
 
 
558 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  27.78 
 
 
612 aa  134  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  25.43 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  23.59 
 
 
598 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  24.1 
 
 
606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  25 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  21.74 
 
 
592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  24.93 
 
 
644 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  24.94 
 
 
615 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  22.5 
 
 
605 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  21.03 
 
 
592 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  23.49 
 
 
640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  28.38 
 
 
630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  24.33 
 
 
640 aa  111  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  24.34 
 
 
640 aa  111  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  24.34 
 
 
640 aa  111  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  21.35 
 
 
592 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  23.45 
 
 
610 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  22.37 
 
 
652 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  27.19 
 
 
424 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  27.17 
 
 
537 aa  103  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  22.34 
 
 
608 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  28.15 
 
 
426 aa  97.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  24.32 
 
 
549 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  27.27 
 
 
512 aa  94  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  24.45 
 
 
627 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  24.55 
 
 
635 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  25.39 
 
 
622 aa  92  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  27.08 
 
 
521 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  24.22 
 
 
657 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  27.87 
 
 
427 aa  90.5  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  22.38 
 
 
627 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  26.28 
 
 
614 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  22.76 
 
 
650 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  22.97 
 
 
612 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  26.1 
 
 
417 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  27.19 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  26.97 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  23.22 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  23.15 
 
 
642 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  22.26 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  22.05 
 
 
581 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  23.11 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  22.42 
 
 
638 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  20 
 
 
821 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  24.61 
 
 
618 aa  83.2  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  26.19 
 
 
616 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.26 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  23.31 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  24.32 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  23.27 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  24.55 
 
 
673 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.55 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.3 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  23.58 
 
 
683 aa  75.1  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  24.5 
 
 
673 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  24.27 
 
 
679 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  24.45 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  22.68 
 
 
529 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  25.49 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  24.89 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  22.3 
 
 
694 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  26.05 
 
 
555 aa  65.1  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  23.29 
 
 
539 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  27.75 
 
 
612 aa  60.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  23.31 
 
 
690 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.91 
 
 
535 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.36 
 
 
431 aa  58.2  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.76 
 
 
530 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  53.49 
 
 
517 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.71 
 
 
372 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  42.37 
 
 
369 aa  48.9  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.63 
 
 
410 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.29 
 
 
365 aa  47.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  37.29 
 
 
408 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>