76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1398 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  100 
 
 
685 aa  1322    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  54.66 
 
 
534 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  47.66 
 
 
554 aa  340  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  39.39 
 
 
639 aa  277  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  35.2 
 
 
514 aa  243  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  39.06 
 
 
499 aa  227  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  32.32 
 
 
427 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  25.83 
 
 
610 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  25.51 
 
 
558 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  25.75 
 
 
614 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  23.46 
 
 
592 aa  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  23.81 
 
 
592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  24.1 
 
 
592 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  23.58 
 
 
605 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  145  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  32.28 
 
 
426 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  24.29 
 
 
570 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.31 
 
 
416 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  28.14 
 
 
615 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  23.96 
 
 
650 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  28.35 
 
 
618 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  28.42 
 
 
644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  25.36 
 
 
616 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  25.04 
 
 
606 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  28.14 
 
 
612 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  22.08 
 
 
821 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  26.44 
 
 
539 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  24.61 
 
 
640 aa  127  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  24.61 
 
 
640 aa  127  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  28.23 
 
 
647 aa  127  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  23.77 
 
 
598 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.2 
 
 
417 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  24.62 
 
 
608 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  29.91 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  23.61 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  27.63 
 
 
538 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  24.29 
 
 
640 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  28.33 
 
 
622 aa  120  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  23.52 
 
 
640 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  29.87 
 
 
635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  24.22 
 
 
581 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  24.72 
 
 
612 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  26.53 
 
 
612 aa  117  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  22.57 
 
 
652 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  27.35 
 
 
615 aa  114  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  26.91 
 
 
627 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  24.39 
 
 
638 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  30.19 
 
 
630 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  25.92 
 
 
635 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  27.38 
 
 
549 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  23.3 
 
 
647 aa  104  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  26.88 
 
 
535 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  24.52 
 
 
642 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  27.59 
 
 
521 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  24.57 
 
 
627 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  26.9 
 
 
537 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  24.72 
 
 
657 aa  97.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.69 
 
 
410 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  28.78 
 
 
673 aa  94  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  27.97 
 
 
512 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  28.36 
 
 
673 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  28.09 
 
 
690 aa  91.3  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  24.84 
 
 
529 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  32.57 
 
 
555 aa  90.1  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  27.72 
 
 
673 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  24.47 
 
 
683 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  26.79 
 
 
694 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.95 
 
 
540 aa  77  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  27.76 
 
 
679 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  29.36 
 
 
540 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  23.33 
 
 
541 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  23.98 
 
 
530 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.56 
 
 
535 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  35.38 
 
 
517 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  22.18 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.48 
 
 
410 aa  44.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>