87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0873 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  100 
 
 		 630 aa  1240    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  53.57 
 
 		 622 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  46.52 
 
 		 627 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  48.81 
 
 		 635 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  44.25 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  40.94 
 
 		 652 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  42.66 
 
 		 657 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  39.75 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  40.94 
 
 		 644 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  38.35 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  38.95 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 640 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  37.74 
 
 		 647 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 640 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  36.06 
 
 		 642 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  35.21 
 
 		 635 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  39.92 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.78 
 
 		 618 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  40.98 
 
 		 512 aa  343  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  36.87 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.07 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35.71 
 
 		 616 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  33.39 
 
 		 614 aa  336  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  33.7 
 
 		 647 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  34.35 
 
 		 612 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  35.65 
 
 		 615 aa  329  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 		 521 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  38.45 
 
 		 537 aa  323  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  33.17 
 
 		 615 aa  323  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.09 
 
 		 611 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  31.66 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  33.7 
 
 		 627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  33.12 
 
 		 694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  33.79 
 
 		 690 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.6 
 
 		 612 aa  302  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  30.77 
 
 		 605 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  31.91 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  32.98 
 
 		 673 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  32.36 
 
 		 679 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  32.67 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  33.38 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  29.71 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  29.55 
 
 		 592 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  31.63 
 
 		 610 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  28.57 
 
 		 592 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.31 
 
 		 581 aa  260  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.64 
 
 		 683 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.67 
 
 		 558 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.2 
 
 		 606 aa  250  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  27.95 
 
 		 570 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  36.62 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.88 
 
 		 612 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  36.87 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  32.94 
 
 		 539 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  33.33 
 
 		 538 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  197  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.15 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.5 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.79 
 
 		 417 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  30.77 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  32.63 
 
 		 555 aa  148  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  32.08 
 
 		 410 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.03 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  28.83 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.8 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  28.91 
 
 		 534 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.99 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.14 
 
 		 685 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.12 
 
 		 514 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  26.62 
 
 		 539 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.07 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  27.55 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.77 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.38 
 
 		 639 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  46.81 
 
 		 104 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  30.59 
 
 		 105 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  30.59 
 
 		 105 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.62 
 
 		 112 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  41.51 
 
 		 350 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  40.32 
 
 		 137 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1493  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  39.62 
 
 		 356 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2312  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 		 111 aa  43.9  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0269727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  44 
 
 		 101 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.38 
 
 		 113 aa  43.5  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  39.39 
 
 		 113 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  48.89 
 
 		 111 aa  43.9  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>