122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1055 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  66.04 
 
 		 541 aa  726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1104    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.18 
 
 		 535 aa  688    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  46.48 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.92 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  40.67 
 
 		 530 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  25.53 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  24.48 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  26.4 
 
 		 630 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.26 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  25.06 
 
 		 635 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  26.64 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  26.51 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  26.87 
 
 		 612 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  23.79 
 
 		 652 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  26.85 
 
 		 616 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  26.8 
 
 		 570 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  24.33 
 
 		 539 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  25.78 
 
 		 618 aa  95.1  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  23.88 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  24.78 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  23.06 
 
 		 821 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  25.81 
 
 		 694 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  24.36 
 
 		 592 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  24.01 
 
 		 592 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  24.36 
 
 		 592 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  24.89 
 
 		 521 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  23.81 
 
 		 647 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  24.65 
 
 		 657 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  24.37 
 
 		 529 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  22.4 
 
 		 610 aa  88.2  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  25.35 
 
 		 622 aa  87  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  23.58 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  26.57 
 
 		 683 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  26.34 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  24.53 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  26.43 
 
 		 608 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  27.48 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  23.68 
 
 		 640 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  24.29 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  26.39 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  25.42 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  24.01 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  23.45 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  23.45 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  24.94 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  24.67 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  24.11 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  24.78 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  27.18 
 
 		 673 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  24.94 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  26.24 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  27.18 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  22.64 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  23.17 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  25.69 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  24.06 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  25.92 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  26.29 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  21.62 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  25.19 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  25.65 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  22.77 
 
 		 410 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  21.83 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  25.96 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  25.93 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  27.56 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  24.2 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.79 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.62 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  24.32 
 
 		 627 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  22.65 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  19.94 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2349  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 184 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 		 168 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.9 
 
 		 149 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  43.48 
 
 		 264 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3791  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.08 
 
 		 162 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628434  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.18 
 
 		 127 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.541744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1286  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  30.86 
 
 		 738 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.499406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0598  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.594311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 57 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.28 
 
 		 133 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0774678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2351  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.17 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.58 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 220 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2008  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 172 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1960  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.74 
 
 		 89 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13680  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  40.98 
 
 		 235 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2701  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 85 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.98 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0425642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1918  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 89 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1836  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.5 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.850455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2178  sulfur reductase, iron-sulfur binding subunit  52.5 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2003  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 89 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>