220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2787 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  100 
 
 		 558 aa  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  36.97 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  36.8 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  36.78 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  35.02 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  35.75 
 
 		 610 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.75 
 
 		 608 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  34.39 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  33.17 
 
 		 614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  33.05 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.39 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  30.93 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.16 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.72 
 
 		 635 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  34.06 
 
 		 581 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  29.97 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.24 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  30.52 
 
 		 622 aa  279  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  30.03 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  29.3 
 
 		 612 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  29.28 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  31.83 
 
 		 627 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.55 
 
 		 647 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  31.96 
 
 		 539 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  34.76 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.06 
 
 		 683 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  28.83 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  30.38 
 
 		 611 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  31.09 
 
 		 627 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  29.04 
 
 		 642 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  30.67 
 
 		 630 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  34.24 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  29.26 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  36.6 
 
 		 512 aa  240  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  29.76 
 
 		 640 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  28.86 
 
 		 615 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  33.49 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  30.1 
 
 		 640 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  30.1 
 
 		 640 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  33.65 
 
 		 638 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  28.1 
 
 		 690 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  29.08 
 
 		 640 aa  233  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  28.44 
 
 		 673 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.7 
 
 		 549 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  27.97 
 
 		 694 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.66 
 
 		 679 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.02 
 
 		 612 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  28.12 
 
 		 673 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  27.66 
 
 		 673 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.5 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  32.86 
 
 		 426 aa  217  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  26.57 
 
 		 650 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  30.14 
 
 		 644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.78 
 
 		 416 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  32.2 
 
 		 537 aa  210  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  31.21 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  30.55 
 
 		 427 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.97 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.5 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  30.75 
 
 		 410 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  27.11 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  25.41 
 
 		 534 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.68 
 
 		 685 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.51 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  28.57 
 
 		 555 aa  146  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  25.09 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  24.81 
 
 		 499 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.03 
 
 		 639 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  27.42 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.6 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.37 
 
 		 540 aa  90.9  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  23.93 
 
 		 530 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.68 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  23.17 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.52 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  36.05 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.17 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.05 
 
 		 408 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  29.91 
 
 		 517 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  30.1 
 
 		 104 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  32.65 
 
 		 104 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  38.64 
 
 		 362 aa  53.9  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.25 
 
 		 365 aa  53.9  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.71 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  29.47 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.71 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.8 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.71 
 
 		 407 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.93 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  31.11 
 
 		 312 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.4 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  36.78 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.05 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  34.57 
 
 		 351 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  35.63 
 
 		 356 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  36.36 
 
 		 356 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>