88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1409 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  100 
 
 		 673 aa  1352    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  91.39 
 
 		 673 aa  1221    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  56.16 
 
 		 683 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  73.45 
 
 		 679 aa  984    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  99.26 
 
 		 673 aa  1341    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  74.21 
 
 		 690 aa  981    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  72.63 
 
 		 694 aa  1002    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  40.62 
 
 		 647 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  34.47 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  35.21 
 
 		 612 aa  347  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  34.31 
 
 		 612 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  32.58 
 
 		 635 aa  336  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  32.5 
 
 		 635 aa  333  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.79 
 
 		 608 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  31.75 
 
 		 642 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  30.49 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  31.11 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  34.2 
 
 		 618 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  30.92 
 
 		 627 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  30.37 
 
 		 657 aa  295  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  31.31 
 
 		 614 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.19 
 
 		 821 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.4 
 
 		 650 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  32.72 
 
 		 622 aa  290  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  30.15 
 
 		 640 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  30.15 
 
 		 640 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  30 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  32.67 
 
 		 630 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  28.98 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  29.82 
 
 		 644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  29.4 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  31.04 
 
 		 611 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  28.98 
 
 		 592 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  28.41 
 
 		 592 aa  270  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.65 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  31.62 
 
 		 615 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  32.31 
 
 		 615 aa  266  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  29.59 
 
 		 647 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  30.35 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  30.49 
 
 		 529 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  30.02 
 
 		 606 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  31.03 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  31.71 
 
 		 512 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  28.55 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  28.36 
 
 		 570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  30.35 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  34.1 
 
 		 521 aa  240  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  27.72 
 
 		 598 aa  239  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  31.43 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  28.12 
 
 		 558 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  35.1 
 
 		 539 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  32.45 
 
 		 612 aa  220  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  29.11 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  33.02 
 
 		 426 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  34.3 
 
 		 417 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.95 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  32.13 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  33.93 
 
 		 417 aa  173  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.79 
 
 		 416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  29.66 
 
 		 538 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  31.94 
 
 		 410 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.25 
 
 		 555 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  27.63 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.68 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.14 
 
 		 685 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.62 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  25.48 
 
 		 514 aa  89  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.88 
 
 		 534 aa  87.8  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  25.69 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.33 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  27.01 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  23.91 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.55 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.78 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  32.38 
 
 		 101 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  32.38 
 
 		 101 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  32.38 
 
 		 101 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  30.48 
 
 		 101 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.28 
 
 		 372 aa  47.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.64 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.56 
 
 		 113 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.61 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.83 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  31.71 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  29.17 
 
 		 226 aa  45.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 564 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  45.83 
 
 		 572 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 575 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>