42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1969 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  100 
 
 
123 aa  248  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  69.61 
 
 
117 aa  147  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  62.5 
 
 
104 aa  137  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  52.94 
 
 
112 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  52.73 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  52.73 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  50.98 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0875  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  43.75 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  39.39 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  39.39 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  44.44 
 
 
598 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  33.04 
 
 
606 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  36 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  33.33 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  35.35 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.61 
 
 
558 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  27.78 
 
 
304 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  34.02 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  35.71 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  34.02 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  31.25 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  34.69 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.88 
 
 
652 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.68 
 
 
618 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  34.34 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  38.1 
 
 
638 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  37.1 
 
 
592 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  33.67 
 
 
98 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  31.76 
 
 
592 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  29.17 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  42.59 
 
 
612 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  29.17 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  34 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  32.94 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  29.17 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  33 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  34.69 
 
 
308 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  41.07 
 
 
610 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  39.34 
 
 
538 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 
586 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>