77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4504 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  67.33 
 
 
144 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  69.39 
 
 
98 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  68.37 
 
 
98 aa  153  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  69.47 
 
 
97 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  70.41 
 
 
98 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  69.47 
 
 
97 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  71.43 
 
 
98 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  48.96 
 
 
128 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  52.63 
 
 
132 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  52.94 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  49 
 
 
120 aa  95.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  49 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  49 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  44 
 
 
120 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  43.69 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  47 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  41.67 
 
 
259 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  29.35 
 
 
304 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  38.82 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  32.94 
 
 
312 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  38.82 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  45.61 
 
 
561 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  43.9 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  44.64 
 
 
586 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  33.33 
 
 
356 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  41.27 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  36.71 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  44.23 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  38.46 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  36.36 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
578 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  53.19 
 
 
558 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  42.37 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  39.29 
 
 
226 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  37.29 
 
 
162 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  33.98 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  33.33 
 
 
357 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  46.43 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  31.58 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  36.84 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  36.84 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  41.94 
 
 
355 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
580 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  34.34 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  37.1 
 
 
616 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  40.32 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  35.23 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  46.94 
 
 
349 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  34.69 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  41.51 
 
 
622 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  38.89 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  30.21 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  44.68 
 
 
571 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  38.71 
 
 
355 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  36.51 
 
 
360 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  34.02 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  41.82 
 
 
572 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  36.14 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  40.43 
 
 
410 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  33.87 
 
 
635 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  32.61 
 
 
650 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  38.46 
 
 
647 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  37.5 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  34.62 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0654  ferredoxin  34.07 
 
 
124 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  31.91 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  35.29 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  39.71 
 
 
564 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
572 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  31.46 
 
 
612 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  45.28 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  45.28 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.52 
 
 
412 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  34.25 
 
 
226 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  31.18 
 
 
638 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>