86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4487 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  100 
 
 
98 aa  199  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  78.57 
 
 
98 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3497  ferredoxin  73.47 
 
 
98 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4504  ferredoxin  71.43 
 
 
102 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162196  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  68.37 
 
 
144 aa  146  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  74.74 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  74.74 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0860  ferredoxin  69.39 
 
 
98 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0001801  hitchhiker  0.0000609894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  50.53 
 
 
128 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0696  ferredoxin (2Fe-2S)  51.58 
 
 
132 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22111  ferredoxin  51.02 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03401  ferredoxin  44.44 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.22792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03411  ferredoxin  44.44 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0322  ferredoxin-like  43.43 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0471  ferredoxin (2Fe-2S)  43 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1863  ferredoxin (2Fe-2S)  42 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03481  ferredoxin  41.41 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03511  ferredoxin  43.43 
 
 
120 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.395732  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47716  predicted protein  35.23 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0463  ferredoxin  39.53 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.170361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0450  ferredoxin  39.53 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33543  predicted protein  38.64 
 
 
259 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  40.26 
 
 
561 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3217  ferredoxin  38.04 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3412  putative hydrogenase component  35.63 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  37.76 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  43.14 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  40.98 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  35.48 
 
 
356 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  45.61 
 
 
586 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  44.26 
 
 
355 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  35.37 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  45.45 
 
 
572 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  46.43 
 
 
558 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46015  predicted protein  35.06 
 
 
356 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1450  ferredoxin  45.45 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3190  2Fe-2S ferredoxin  50 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  34.69 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0047  ferredoxin  36.67 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47958  predicted protein  33.33 
 
 
312 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3929  ferredoxin  50 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  41.07 
 
 
580 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  35.71 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  43.64 
 
 
572 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  33.33 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0329  ferredoxin  36.05 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.378645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  46.88 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  41.07 
 
 
578 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  44.44 
 
 
618 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  34.41 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  37.29 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  46.81 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  41.67 
 
 
226 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
564 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  46.67 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.61 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  36.46 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3470  ferredoxin  33.33 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  34.04 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  43.14 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49724  predicted protein  33.72 
 
 
357 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0265864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  37.7 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  40.82 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  34.41 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.43 
 
 
650 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  31.68 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  37.7 
 
 
355 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  30.39 
 
 
119 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  36.07 
 
 
360 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  40.35 
 
 
612 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  31.68 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  31.68 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0760  ferredoxin, 2Fe-2S  40.38 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4717  ferredoxin  31.03 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  41.18 
 
 
226 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  35.23 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  34.48 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  40.22 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  40 
 
 
222 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  39.58 
 
 
616 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  35.79 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  40.82 
 
 
589 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  33.75 
 
 
106 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  43.64 
 
 
598 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.88 
 
 
652 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  26.32 
 
 
638 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>