232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0730 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  69.16 
 
 		 107 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  56.07 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  54.21 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  53.27 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  52.34 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  53.77 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  52.34 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  51.4 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  51.4 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  51.85 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  51.85 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  48.11 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  50.47 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  50.93 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  49.53 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  51.4 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  48.6 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  49.53 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  48.35 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  43.93 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  40.57 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  42.45 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  42.45 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  45.63 
 
 		 110 aa  84.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  41.51 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  44 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.74 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  40.78 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  43.14 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  43.12 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  46.15 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  45.1 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  42.16 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  40.38 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  42.57 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  38.68 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  34.91 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  34.91 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  34.91 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40.57 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  36.79 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  40.57 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  44.57 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  36.89 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  42.57 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  36.67 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  36.73 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  39.22 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  35 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  41.9 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  43.28 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.57 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.62 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.57 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  43.18 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  38.04 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  41.67 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>