253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3169 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  100 
 
 		 160 aa  326  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  67.92 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  67.3 
 
 		 160 aa  234  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  66.25 
 
 		 160 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  39.22 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  37.76 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  37.76 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  40 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.62 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  36.27 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.25 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.04 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  35.14 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  36.67 
 
 		 618 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.63 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  32.61 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  32.95 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  33.75 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  35.16 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  31.18 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.04 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.78 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.82 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  34.95 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  33.01 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  36.78 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  37.66 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  33.75 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.64 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  32.5 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.95 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  35 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.57 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  43.24 
 
 		 578 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  32.08 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.66 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  38.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.95 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.65 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  34.31 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  37.33 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  35.06 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.57 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  36.84 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  32.5 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.5 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.5 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  39.71 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.5 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  32.5 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.66 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  34.95 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.5 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  31.68 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  44.44 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  37.33 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  44.44 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  40.26 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.53 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  38.81 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  38.16 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  42.35 
 
 		 571 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  37.08 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.91 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  31.82 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.82 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  30.69 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01060  hypothetical protein  35.14 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  33.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.67 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 		 580 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.61 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  32.47 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>