252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2112 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  100 
 
 
107 aa  219  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  94.39 
 
 
107 aa  210  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  94.39 
 
 
107 aa  210  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  72.64 
 
 
106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  70.75 
 
 
106 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  73.58 
 
 
106 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  71.7 
 
 
106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  70.75 
 
 
106 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  70.75 
 
 
106 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  70.75 
 
 
106 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  66.04 
 
 
106 aa  159  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  68.87 
 
 
106 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  66.04 
 
 
106 aa  149  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  61.32 
 
 
106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  66.04 
 
 
106 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  64.15 
 
 
106 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  64.49 
 
 
106 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  63.55 
 
 
106 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  61.32 
 
 
106 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  62.26 
 
 
106 aa  139  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  64.15 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  59.81 
 
 
106 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  63.21 
 
 
106 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  59.43 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  61.32 
 
 
106 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  59.81 
 
 
107 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  59.81 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  57.01 
 
 
107 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  56.07 
 
 
107 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  57.01 
 
 
107 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  57.01 
 
 
107 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  53.7 
 
 
107 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  55.14 
 
 
107 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  55.14 
 
 
130 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  55.14 
 
 
106 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  53.27 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  51.4 
 
 
106 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  54.63 
 
 
107 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  50.47 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  51.89 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  49.53 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  53.27 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  50 
 
 
106 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  51.4 
 
 
105 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  56.6 
 
 
106 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50.93 
 
 
107 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  50.47 
 
 
107 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  49.06 
 
 
106 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  48.54 
 
 
106 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  47.62 
 
 
105 aa  100  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  43.12 
 
 
108 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  49.53 
 
 
107 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  50.93 
 
 
107 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  46.67 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  44.66 
 
 
106 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  48.15 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  46.73 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  49.44 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  45.45 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  46.53 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  42.06 
 
 
106 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  52.17 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  46.6 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  46.6 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  47.57 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  47.66 
 
 
106 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  47.66 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  46.73 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  44.66 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  47.62 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  44.76 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  43.81 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  43.14 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  40.59 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  40.2 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40.57 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  46.73 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  37.62 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  40.57 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  40.38 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  44.95 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  39.62 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  43.14 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.2 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  44.76 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  42.59 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  44.32 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>