239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0297 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
111 aa  229  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  61.32 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  59.81 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  58.33 
 
 
116 aa  138  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  54.72 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  61.22 
 
 
104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  54.13 
 
 
144 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  55.56 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  57.41 
 
 
119 aa  125  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  46.73 
 
 
110 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  54.21 
 
 
217 aa  120  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  54.63 
 
 
118 aa  118  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  54.63 
 
 
118 aa  118  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  59.09 
 
 
110 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  51.43 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  46.73 
 
 
111 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  43 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  50.94 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  43 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  43 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  53.93 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  38.61 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  40.2 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  41.58 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  44.55 
 
 
107 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  44.55 
 
 
107 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.81 
 
 
111 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  42.57 
 
 
107 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.81 
 
 
111 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  52.81 
 
 
111 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.81 
 
 
111 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  52.81 
 
 
111 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  39 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.81 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.81 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  43 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  44.55 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  40.59 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  42.72 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.69 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  42.72 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  38 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  42.57 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  47.47 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  37.62 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  42.57 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  42.72 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  47.71 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  50.56 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.71 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  42.57 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  39 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.48 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  38.46 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  40.2 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.56 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  40 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  39 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.71 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.48 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.48 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.48 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  44.94 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.44 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  37.25 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  40.2 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  43.14 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  38 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  38 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  49.44 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  37 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  47.47 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  35 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
107 aa  77  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.35 
 
 
113 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.37 
 
 
106 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
107 aa  77  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.46 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  37.62 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  36.54 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  40.59 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.46 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  51.69 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.46 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.46 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>