208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14478 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  100 
 
 
112 aa  234  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  55.17 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  55.17 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  51.43 
 
 
111 aa  113  7.999999999999999e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  49.5 
 
 
217 aa  108  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  50 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  47.12 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  50 
 
 
110 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  50.89 
 
 
119 aa  104  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  49.53 
 
 
116 aa  103  6e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  49.53 
 
 
116 aa  103  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  49.49 
 
 
104 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  44.34 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  45.37 
 
 
110 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  38.1 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  48.54 
 
 
106 aa  77  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  40.57 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.83 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  46.94 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  46.94 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.74 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  45.36 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  45.19 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.42 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.92 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  45.92 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  44.33 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.74 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  45.45 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  45.65 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.65 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.92 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.65 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.71 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.82 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  39.22 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.86 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.84 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  43.33 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  37.62 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  37 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.16 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  43.16 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  42.86 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.42 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  41.84 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.72 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.72 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.72 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.42 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  39.42 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.42 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.42 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  39.25 
 
 
445 aa  64.3  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  36.27 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.42 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.42 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  42.72 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  41.84 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.82 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.82 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  42.72 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.24 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  51.09 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.82 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.35 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.8 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  37 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.8 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.42 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.72 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  39.42 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.42 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  35.29 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.46 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.45 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  31.31 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.46 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  38.46 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  38.46 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>