231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0615 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  100 
 
 		 104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  84.16 
 
 		 110 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  70.3 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  61.22 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  56.73 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  56.73 
 
 		 116 aa  124  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  57.69 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  51.52 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  54.72 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  53.54 
 
 		 217 aa  110  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  49.51 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  55.45 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  55.45 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  51.96 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  50.49 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  48.57 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  48.57 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  49.49 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  47.12 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  47.12 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  47.57 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  46.15 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  45.71 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  46.15 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  47.12 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  46.15 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  48.57 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  43.27 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  46.15 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  46.67 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  44.23 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  44.23 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  45.36 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  49.02 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  50.52 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  44.76 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.31 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  45.71 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  43.27 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  45.71 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  44.23 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  44.55 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.12 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  44.76 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  41.9 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  43.81 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  43.69 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  43.69 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.15 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.15 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  46.15 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.19 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  42.57 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  47.96 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.31 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  48.08 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  43.9 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 		 445 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.86 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  39.81 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.34 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.38 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.93 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  43.4 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  41.58 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.67 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  41.84 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.35 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  46.51 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  46.51 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>