251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1026 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
107 aa  219  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 
107 aa  219  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  94.39 
 
 
107 aa  210  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  73.58 
 
 
106 aa  166  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  71.7 
 
 
106 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  72.64 
 
 
106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  70.75 
 
 
106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  66.98 
 
 
106 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  69.81 
 
 
106 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  66.98 
 
 
106 aa  151  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  66.04 
 
 
106 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  66.04 
 
 
106 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  67.29 
 
 
106 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  67.92 
 
 
106 aa  146  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  66.36 
 
 
106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  66.04 
 
 
106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  60.38 
 
 
106 aa  141  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  65.09 
 
 
106 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  62.26 
 
 
106 aa  140  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  61.32 
 
 
106 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  65.09 
 
 
106 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  63.21 
 
 
106 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  61.68 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  58.49 
 
 
106 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  58.88 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  57.01 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  57.94 
 
 
107 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.94 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  56.07 
 
 
130 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  52.78 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  55.14 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  54.21 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  54.21 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  54.21 
 
 
106 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  56.48 
 
 
107 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  53.27 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  52.83 
 
 
106 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  51.4 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  49.53 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  49.53 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  54.21 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  48.11 
 
 
106 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  51.85 
 
 
107 aa  103  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  48.57 
 
 
105 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  49.51 
 
 
106 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  56.6 
 
 
106 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  49.53 
 
 
105 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  48.57 
 
 
104 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  44.04 
 
 
108 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  50.93 
 
 
107 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  49.53 
 
 
107 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  50.93 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  46.23 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  46.23 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  46.23 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  43.93 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  47.66 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  48.6 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  54.35 
 
 
95 aa  95.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  49.44 
 
 
103 aa  95.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  44.44 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  43.69 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  48.54 
 
 
118 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  46.53 
 
 
111 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  49.53 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  47.57 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  45.63 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  46.6 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  49.52 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  44.86 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  46.79 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  47.06 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  42.16 
 
 
106 aa  84.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  44.12 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  43.69 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  38.61 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  41.51 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  41.51 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  46.73 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  40.38 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  37.74 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  44.95 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.44 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  37.62 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  50.57 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  43.52 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.52 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  42.16 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>