253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3057 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  100 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  59.26 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  59.41 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  57.69 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  59.09 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  53.54 
 
 		 217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  48.65 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  55.45 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  48.65 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  49.53 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  50 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.44 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.44 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.44 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  47.87 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  48.25 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.79 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  54.35 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  54.35 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  48.62 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.25 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  49.12 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  48.67 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  48.25 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.79 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  46.9 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  46.9 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.54 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  47.66 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.6 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.6 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.66 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.54 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  48.6 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  46.9 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  47.66 
 
 		 112 aa  94.4  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.53 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  46.36 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  46.02 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.66 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.66 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.66 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  47.66 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.9 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  47.79 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.73 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.47 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  43.69 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  49.53 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.63 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.86 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  46.79 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.25 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  44.35 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.12 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.79 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  49.12 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.79 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.13 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.13 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.13 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  45.87 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  45.13 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.86 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.25 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.86 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  43.93 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.74 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>