241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1088 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  94.34 
 
 		 106 aa  213  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  86.79 
 
 		 106 aa  200  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  85.85 
 
 		 106 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  86.79 
 
 		 106 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  85.85 
 
 		 106 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  85.85 
 
 		 106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  72.64 
 
 		 106 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  73.58 
 
 		 107 aa  166  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  73.58 
 
 		 107 aa  166  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  71.7 
 
 		 107 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  67.92 
 
 		 106 aa  155  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  68.57 
 
 		 106 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  67.62 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  69.52 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  147  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  61.9 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  60.38 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  59.43 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  58.49 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  120  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  54.21 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  48.11 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  47.57 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  45.79 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  50 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  42.45 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  43.69 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  45.19 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  42.31 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  41.3 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  42.16 
 
 		 109 aa  85.9  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  42.57 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  39.05 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  36.63 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  38.83 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  35 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  33 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  34.29 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  40.95 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  37.62 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.05 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  42.57 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.74 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.57 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  39.62 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.14 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.85 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  42.7 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  38 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.14 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 445 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.19 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.19 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>