229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4980 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  97.17 
 
 		 106 aa  213  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  95.28 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  82.08 
 
 		 106 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  83.96 
 
 		 106 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  79.25 
 
 		 106 aa  180  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  73.33 
 
 		 106 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  72.38 
 
 		 106 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  72.38 
 
 		 106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  69.52 
 
 		 106 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  67.92 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  67.92 
 
 		 106 aa  151  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  67.92 
 
 		 107 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  67.92 
 
 		 107 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  66.04 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  66.04 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  61.32 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  55.88 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  60.19 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  55.66 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.41 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  49.52 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  50.94 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  52 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  49.51 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  48.6 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  49.53 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  51.46 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  47.57 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  46.15 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  45.79 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  46.15 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  44.66 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  47.06 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  43.93 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  43.93 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  41.9 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  44.12 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  43.01 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  43.4 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  39.05 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  39.05 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  42.72 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  39.62 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  40 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  39.81 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  40.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  38.3 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  43.43 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  40.2 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  40.2 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  39.6 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  39.39 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.23 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  37.23 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.63 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.63 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>