185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1783 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  55.56 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  55.56 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  55.14 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  53.7 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  51.4 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  49.07 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  49.53 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  49.07 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  45.37 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  50.47 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  48.6 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.93 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  43.93 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  43.93 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  45.79 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  42.99 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  44.04 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  43.12 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  44.04 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  48.6 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  50.93 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  47.22 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  46.3 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  46.3 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  46.3 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  42.59 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  50.47 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  94  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  42.99 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  44 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  44.23 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  40.74 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  47.62 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  40.19 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  40.19 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  40.19 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  40.19 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  43.52 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  43.12 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  42.59 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  42.59 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  40.95 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  42.31 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  52.44 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  42.72 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.12 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  40.19 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  39.62 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  44.44 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  41.28 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  39.6 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  40.74 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  39.05 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  36.63 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  39.22 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  37.96 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  33.65 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  36.89 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  32.04 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  34.95 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.61 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  35 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 445 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  34.62 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.68 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  35.35 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.11 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.5 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.03 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>