100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4893 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  76.42 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  41.41 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  41.41 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.27 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  42.16 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  42.16 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  41.41 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  39.18 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  40 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  40.82 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  39.8 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  39.22 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  38.78 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  37.11 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  40 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  40.4 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  35.35 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  37.76 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  36.63 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  38 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  35.35 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  34.31 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  37 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  41.84 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  35.35 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  35.29 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  37.14 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  33.01 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  37.86 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  34.34 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  36.73 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  36.46 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  37.37 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.59 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  32.99 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  34.02 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  32.35 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  33.67 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  37.97 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  30.39 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  31.37 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  36.25 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  34.02 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  31.96 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  36.89 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  33.67 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  33.66 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  32 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  32 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 		 445 aa  50.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  33.72 
 
 		 577 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1812  hypothetical protein  28.72 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.579583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  28.43 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  27.45 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 589 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  29.35 
 
 		 111 aa  43.9  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 		 578 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  32.29 
 
 		 107 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  32.94 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  35.56 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>