217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5299 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  220  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  59.81 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  53.33 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.55 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  57.55 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  121  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  53.33 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  49.53 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  49.53 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  50.98 
 
 		 106 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  50 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  45.19 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  47.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  45.45 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  45.1 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  43 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  46.08 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  48.48 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  49.02 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  45.19 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  47 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  40.59 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  42 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  47.06 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  41 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  46.08 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  44.55 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  41.9 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  43.88 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.45 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  37.37 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  40.78 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  39.05 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  35.51 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  35.35 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  39.36 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  37.37 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  37 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  40.2 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  40.2 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  40.2 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1812  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.579583 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  35.35 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  44.12 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  35.92 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  34.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.12 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>