190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3592 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  53.27 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  53.27 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  52.38 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  49.52 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  50 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  48.57 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  51.38 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  49.54 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  46.79 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  46.79 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  52.94 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  46.79 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  49.41 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  47.22 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  42.99 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  49.49 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  41.35 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  44.34 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  43.14 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  42.86 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  48.08 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  41.41 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  42.99 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  40.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  47.19 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  40.21 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  36.45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  39.05 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  37.86 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  37.37 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  39.81 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  38 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  37.14 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  39.62 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  39 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 445 aa  67  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  37.14 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  39.18 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  34.34 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  34.02 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  34.65 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  31.37 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.78 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  33.01 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  33.01 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  35.29 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  29.7 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  38.71 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  39.25 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.91 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>