229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3131 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  133  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  52.83 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  51.89 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  52.83 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  52.83 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  49.06 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  43.4 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  47.17 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  50 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  46.08 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  45.28 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  43.27 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  44.12 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  41.51 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  44.12 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  40.2 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  39.62 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  42.16 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  44.12 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  42.31 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  43 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  39.81 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  39.6 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  39.81 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  36.89 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  34.95 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  37.37 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  36.7 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  39.05 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.38 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  38.32 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.32 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  38.32 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.32 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.32 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  36.36 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  38.32 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.32 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  37.38 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.38 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 445 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.32 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.38 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>