218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1998 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  217  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  53.12 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  48.6 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  48.62 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  48.6 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  49.53 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  49.53 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  47.47 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  48.11 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  49.49 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  44.34 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  48.96 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  41.12 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  43.4 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  39.25 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  43.4 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  47.92 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  38.32 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  39.25 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  39.25 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  39.25 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  38.68 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.53 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  41.35 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  41.41 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  32.32 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  38.54 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  42.45 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  37.96 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  37.74 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  41.38 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  41.41 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  39.18 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  41.05 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  36.46 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.38 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  40.59 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  38.83 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  39.53 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  39.53 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  36.45 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  36.45 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  36.45 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  43.02 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  40.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  36.63 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  38.1 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.04 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  35.35 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.62 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  39.58 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>