234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6602 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  92.45 
 
 		 106 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  83.02 
 
 		 106 aa  183  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  82.08 
 
 		 106 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  81.13 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  77.36 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  69.52 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  68.57 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  65.71 
 
 		 106 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  66.98 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  64.15 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  62.26 
 
 		 106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  57.55 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  55.66 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  52.83 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  51.96 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  49.52 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  53.77 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  49.5 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  49.06 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  47.66 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  47.12 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  44.86 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  44.23 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  51.09 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  48 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  42.45 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  43.14 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  47.57 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  42.72 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  41.35 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  42.99 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  42.99 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  39.05 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  38.61 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  43.48 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  43.14 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  39.05 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  41.75 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  35.92 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  46 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  41.58 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  36.54 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  40.78 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  41.57 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  40.4 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  40.4 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  37.86 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  37.86 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  39.33 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  41.57 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  40.45 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.59 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  42.11 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  43.42 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.77 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.79 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  35 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>