225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2185 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  98.11 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  81.13 
 
 		 106 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  79.25 
 
 		 106 aa  176  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  73.58 
 
 		 106 aa  173  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  69.81 
 
 		 107 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  153  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 		 107 aa  150  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  66.04 
 
 		 107 aa  150  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  65.09 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  62.26 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  66.98 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  136  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.55 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  55.66 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  121  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  49.52 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  46.67 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  53.12 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  51.46 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  44.86 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  49.06 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  47.12 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  38.83 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  47.17 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  47.06 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  47.57 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.37 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  49.41 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  44.66 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  39 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  43.4 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  42.99 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  41.9 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  41.9 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  42.57 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  38.68 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  41.35 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  39.05 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  40.59 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  41.51 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  41.58 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.38 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  36.89 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  35.85 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  35.92 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.1 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>