224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00160 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  52.17 
 
 
144 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  65.98 
 
 
116 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  65.98 
 
 
116 aa  135  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  58.1 
 
 
119 aa  125  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  57.52 
 
 
118 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  57.52 
 
 
118 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  59.14 
 
 
110 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  57.14 
 
 
109 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  54.21 
 
 
111 aa  120  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  53.54 
 
 
104 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  53.54 
 
 
110 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  49.5 
 
 
112 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  48.6 
 
 
110 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  44.86 
 
 
111 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  44.34 
 
 
111 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  46.88 
 
 
112 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.83 
 
 
111 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  46.32 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  46.32 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.32 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.74 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.74 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  39.22 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  35.92 
 
 
106 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  38.61 
 
 
106 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  38.24 
 
 
106 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  37.25 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  42.45 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  43.93 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  37.25 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.24 
 
 
112 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  39.6 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  42.99 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  38.61 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  42.59 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  51.28 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  44 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  47.13 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.13 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  41.12 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.57 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.56 
 
 
113 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43 
 
 
111 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43 
 
 
111 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43 
 
 
111 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  44 
 
 
111 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  44.57 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  35.64 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  43 
 
 
111 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  37.11 
 
 
106 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  35.64 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  38.68 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  34.65 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.48 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  33.98 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.27 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  39.29 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  37.62 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  39.18 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42 
 
 
112 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  39.36 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.69 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  40.66 
 
 
106 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  36.94 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  48.53 
 
 
107 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.69 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  36.63 
 
 
106 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.69 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  41.3 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  45.78 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  35.64 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.11 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  36.63 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  47.25 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  41.24 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.11 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  37.84 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.48 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  33.02 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>