235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2026 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  70.3 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  62.04 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  62.39 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  61.47 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  54.72 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  54.37 
 
 		 144 aa  123  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  59.41 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 		 217 aa  121  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  51.38 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  53.64 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  50.93 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  49.09 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  53.77 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  53.77 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  50.49 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  50.49 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  48.54 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  48.04 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  44.23 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  45.63 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  47.96 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  45.63 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.1 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  85.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  50.52 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.95 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  51.52 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  44.04 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  42.45 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  45.71 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  44.34 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  44.04 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.87 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.79 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.17 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  40.38 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.87 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.95 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.95 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.12 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.95 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  43.12 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.12 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  38.83 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>