294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1329 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  100 
 
 
112 aa  226  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  82.88 
 
 
111 aa  193  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  81.08 
 
 
111 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  81.08 
 
 
111 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  81.08 
 
 
111 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  78.38 
 
 
111 aa  189  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1137  ferredoxin, 2Fe-2S  75.89 
 
 
112 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.95717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  80.18 
 
 
111 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  76.79 
 
 
112 aa  188  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  78.38 
 
 
111 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.68 
 
 
112 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  78.57 
 
 
112 aa  188  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.68 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.68 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.68 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  79.46 
 
 
112 aa  187  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.68 
 
 
112 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  76.79 
 
 
115 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  77.68 
 
 
112 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  74.77 
 
 
111 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  78.18 
 
 
111 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  78.18 
 
 
111 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.27 
 
 
111 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  77.27 
 
 
111 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  76.36 
 
 
111 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  78.18 
 
 
111 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  75.45 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  75.45 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  75.45 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  75.45 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  75.45 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  74.55 
 
 
111 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  74.11 
 
 
113 aa  177  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  72.73 
 
 
111 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1781  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  80.36 
 
 
112 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.695057  hitchhiker  0.0000073514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  72.32 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1493  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  81.08 
 
 
111 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  70.91 
 
 
111 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  70 
 
 
111 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2312  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  80.18 
 
 
111 aa  169  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0269727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  73.21 
 
 
112 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2866  ferredoxin, 2Fe-2S  80.36 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000015343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  68.75 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  66.96 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  66.96 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01060  hypothetical protein  75.89 
 
 
112 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004355  ferredoxin 2Fe-2S  75 
 
 
112 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  66.96 
 
 
112 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  68.47 
 
 
113 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  67.26 
 
 
113 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  61.26 
 
 
113 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  67.26 
 
 
113 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  67.26 
 
 
113 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  65.49 
 
 
113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  66.67 
 
 
113 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  64.6 
 
 
113 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  63.39 
 
 
112 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  63.39 
 
 
112 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  66.37 
 
 
113 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  66.37 
 
 
113 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  66.37 
 
 
113 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  66.37 
 
 
113 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  61.61 
 
 
114 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  64.6 
 
 
113 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  63.72 
 
 
113 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  61.26 
 
 
113 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  63.72 
 
 
113 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  63.96 
 
 
113 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  62.5 
 
 
112 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  60.71 
 
 
112 aa  148  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0253  ferredoxin, 2Fe-2S  58.18 
 
 
112 aa  147  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  58.04 
 
 
112 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  60.71 
 
 
112 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  59.82 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  60.71 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  58.93 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  60.71 
 
 
112 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  58.04 
 
 
112 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.14 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  58.93 
 
 
112 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.14 
 
 
112 aa  141  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  54.46 
 
 
112 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  58.56 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2139  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.14 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1643  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  57.14 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.930486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>