245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3549 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  75.47 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  69.52 
 
 		 106 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  69.52 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  69.81 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  70.48 
 
 		 106 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  68.87 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  69.52 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  67.92 
 
 		 106 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  65.09 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  65.09 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  60 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  63.21 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  58.49 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  57.94 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  46.23 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  50.93 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  50.93 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  46.23 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  47.57 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  51.89 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  50 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  45.71 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  45.79 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  45.19 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  47.06 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  44.86 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  46.6 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  40 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  43.81 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  43.81 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  42.86 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  43.01 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  44.86 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  41.41 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  43.64 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  44.55 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  37.61 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  44.55 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  48.48 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  38.61 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  38.83 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  37 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.67 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  40.95 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.95 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.71 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.95 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  40.95 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>