239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0795 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  71.3 
 
 		 111 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  64.22 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  55.56 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  50.93 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  53.27 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  46.3 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  48.21 
 
 		 116 aa  106  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  47.32 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  44.86 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  49.53 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  50.49 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  49.09 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  46.53 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  46.53 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  46.53 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  45.87 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  45.87 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  44.34 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  47.52 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  53.85 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.57 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  42.57 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  44.55 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  51.65 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  43.56 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  39.81 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  50 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  46.67 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  46.67 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  42 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  42 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  42.53 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  42 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  48.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  46.67 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  48.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  48.89 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.33 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  44.33 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  45.71 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  46.67 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  45.56 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  40 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  39.22 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  36.89 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.56 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  48.91 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.15 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  42 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.05 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.05 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.05 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.57 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.74 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  40.38 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  38 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  40.95 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  46.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  45.56 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.31 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>