227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4835 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  221  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  79.05 
 
 		 106 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  73.33 
 
 		 106 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  69.81 
 
 		 107 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  71.7 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  71.7 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  66.04 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  69.81 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  64.76 
 
 		 106 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  68.52 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  65.71 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  147  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  68.87 
 
 		 107 aa  147  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  65.71 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  63.81 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  65.71 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  65.09 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  64.15 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  61.9 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  135  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  59.81 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  60 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  57.01 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  57.01 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  48.11 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  50 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  50 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  49.04 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  47.66 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  49.02 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  50.94 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  48.48 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  50 
 
 		 110 aa  97.1  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  50 
 
 		 104 aa  95.9  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  49 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  46.53 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  43.69 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  47.5 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  42.31 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  46.15 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  40.78 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  38.1 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  40.2 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  39.22 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  39.42 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  39.6 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  38.61 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  38.38 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  40.95 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  40.38 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.51 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.74 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  39 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.05 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  39.81 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.45 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.45 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 445 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.45 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.45 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.45 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>