199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0509 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  62.38 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  57.01 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  54.29 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  54.29 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  44.55 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  45.28 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  48.98 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  37.14 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  42.45 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  46.73 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  46.73 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  44.76 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  39.42 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.16 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  40.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  39.05 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  38.68 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  39.25 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  40 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  39.25 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  36.36 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  38.78 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  39.62 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  37.38 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  40.59 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  39.62 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  39.6 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  36.89 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  39.39 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  41.28 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  37 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  38.61 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  39.6 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  37.62 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  36.7 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  36.89 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  36.73 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  33.96 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  42.16 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  35.85 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  33.65 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  36.46 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  35.78 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.5 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  35.92 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  39.77 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  33.96 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  37.76 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  31.07 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  36.45 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  31.13 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  30.77 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  30.1 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  35.24 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  33.33 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  39.53 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.78 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.5 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  29.52 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  35.79 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  34.44 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.93 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  31.13 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.11 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 445 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.26 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  37.36 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.78 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  37.93 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.9 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>