191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4602 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  44.76 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  42.72 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  47.12 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  45.28 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  39.62 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  36.63 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  41.58 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  41.24 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  39.62 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  45.12 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  41.86 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  35 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  38.82 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  41.41 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  34.31 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1324  ferredoxin  37.74 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  35.42 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  37.25 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  39.18 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  38.38 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  39.18 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  36.27 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  37.23 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  32.43 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  38.04 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  41.11 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  38.2 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  38.2 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  44 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  36.08 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  39.51 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  38.71 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  37.21 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  37.5 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  42.03 
 
 		 445 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  43.43 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  42.68 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  43.53 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  32.04 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  38.95 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.3 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  32.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  37.62 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.24 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.42 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  37.89 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  41.25 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  37.89 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 		 561 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  34.34 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  38.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  38.55 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  38.55 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  39.19 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.68 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  31.68 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  36.96 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  39.02 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.68 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  29.7 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  40.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  40 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.23 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  40.58 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  40 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  37.04 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.84 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.84 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.84 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>