134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1324 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1324  ferredoxin  100 
 
 
105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  65.42 
 
 
111 aa  141  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  63.81 
 
 
107 aa  140  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  42.86 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  39.6 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  37.74 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  39.78 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  41.03 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  38.78 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  38.27 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  37.63 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 
217 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  32.63 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  34.95 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  38.55 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  34.62 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  38.55 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  39.51 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  38.27 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  32.65 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  38 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  37.8 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  32 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  38.82 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  34.57 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  32.97 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  36.84 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  36 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
445 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  40 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  36.9 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  36.47 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  39.47 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  42.11 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  44.78 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  33.64 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  37.36 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  37.21 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  36.59 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  35.71 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  34.29 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  35.92 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  33.73 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  36 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  33.96 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  33.66 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.42 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  36.84 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  38.16 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  34.31 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  36.84 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  35.42 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  38.03 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  38.16 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  34.31 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  39.47 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  35.42 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  35.38 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  36.05 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  33.01 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  35.38 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  35.38 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  42.62 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  30.77 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  36.84 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  38.71 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.44 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  33.33 
 
 
109 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  33.33 
 
 
105 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.8 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  41.54 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  43.75 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  28.4 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.8 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  32.88 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  44.78 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  35.8 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.8 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  35.37 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  39.68 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  36.47 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  31.96 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  32.35 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  32.35 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  32.35 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  36.47 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  36.76 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.73 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  34.57 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  40.3 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  31.17 
 
 
577 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  33.67 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  29.91 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  39.68 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.58 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  36.25 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  36.25 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>