215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0408 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  100 
 
 		 107 aa  220  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  59.22 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  59.41 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  41 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1324  ferredoxin  45.88 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  43.68 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  39 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  40.45 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  37 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  36.36 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  39.09 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  36.63 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  41.75 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  39.42 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  40.78 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  41.25 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  45.31 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.52 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  35.24 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  47.14 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  37.33 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  34.34 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  34.52 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  37.62 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  47.89 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  36.99 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  34.31 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  36.99 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  39.25 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  37.93 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  36.89 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  37.37 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  34.34 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  42.25 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  34 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  36.89 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  39.45 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  37.66 
 
 		 571 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  36.63 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  37.5 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  35.48 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  34.58 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  35.64 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  30.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 		 558 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  33.96 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  37.78 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 586 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  38 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  38 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  38.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  34.62 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.25 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  35.58 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 572 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  34.62 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 592 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  34.58 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  38.14 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  32.04 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  35.62 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  42.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  34.62 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  33.02 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  35.64 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  33.64 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  42.86 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  41.25 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  40 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  34.41 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.53 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  32.71 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 572 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  38.46 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  35.35 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  35.14 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  41.3 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  35.87 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.79 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  33.66 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 		 580 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.81 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  38.81 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  32.93 
 
 		 592 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 589 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.81 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>