155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4120 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0408  ferredoxin  59.41 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0142  ferredoxin  42.59 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  42.57 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  42.45 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  44.21 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1324  ferredoxin  40.66 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  42.86 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  42.16 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  41 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  44.09 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  41.05 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  41.84 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  39.58 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  40.66 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  41.49 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  41.3 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  41.49 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  39.58 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  40.86 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  48.48 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  42.55 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  40.43 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  42.5 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  41.76 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  40.43 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  40.86 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  40.4 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  40.66 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  40.59 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  36.84 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16510  ferredoxin  36.79 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  39.76 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  36.19 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  38.95 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  39.13 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  38.61 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  40.45 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  39.78 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  39.56 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  37.23 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  35.62 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  41.76 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  35.29 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4602  ferredoxin  41.25 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  36.79 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  36.84 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  39.56 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  36.71 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  37.62 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  36.71 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  36.71 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  38.46 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0503  ferredoxin  35.37 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  37.93 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  40.43 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  43.53 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  35.85 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4487  ferredoxin  35.37 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.51 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  37.11 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  35.85 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  39.58 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  35.11 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.94 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  39.29 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  40.91 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  36.11 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  36.46 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  45.31 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  34.95 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  34.29 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  38.89 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  38.3 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  38.3 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  38.81 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  38.3 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  36.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  36.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  32.93 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1064  ferredoxin, 2Fe-2S type  39.24 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.975395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  33.96 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  35.85 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  37.76 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  50 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  38.95 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  30.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  33.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  45.1 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  37.66 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.8 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  39.24 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>