193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1417 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  100 
 
 		 101 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  66.67 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  59.41 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  64.36 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  64.58 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  61.96 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1905  ferredoxin  56.44 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0121  putative ferredoxin, 2Fe-2S  51.52 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1257  ferredoxin  51.49 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1541  ferredoxin, putative  51.49 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  44.09 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0407  2Fe-2S ferredoxin  47.52 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934489  normal  0.311867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  38.14 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  38.14 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  38.14 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  37.11 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  37.63 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  32.5 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.7 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1136  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.22 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.23 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  34.44 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.23 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1634  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3994  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38929  normal  0.0257011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  32.95 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  31.82 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  36.25 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1564  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.11 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0847  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.23 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  34.09 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  34.09 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.23 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2183  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.82 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  31.82 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  34.18 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2285  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  31.82 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1439  (2FE-2S) ferredoxin  30 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101111  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2147  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.7 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.442725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  29.41 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.61 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4607  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.95 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2448  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.09 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.47 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  36.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  33.77 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  34.88 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  33.77 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  29.55 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  32.56 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  33.77 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  29.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.89 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  28.42 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  33.77 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  43.86 
 
 		 644 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2257  putative ferredoxin (2Fe-2S) protein  27.27 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.55 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1488  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.67 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  35.48 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  38.55 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  36.08 
 
 		 612 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  32.47 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.37 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.37 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1643  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.930486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  38.46 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3215  ferredoxin  29.79 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0952448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1955  ferredoxin, 2Fe-2S type  27.37 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.921826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  30 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1030  ferredoxin, 2Fe-2S type  27.37 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891184  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  27.27 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2139  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.95 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  35.64 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4120  ferredoxin  32.93 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.221496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  31.18 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  32.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  25.51 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.51 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  30.77 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  25.51 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3269  ferredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.430964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 558 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1042  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.4 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  24.49 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  28.12 
 
 		 652 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  24.49 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  30.86 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  24.49 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  28.05 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  26.83 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  24.49 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>