69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0340 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0191  ferredoxin  55.46 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000967287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2983  ferredoxin  54.7 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00931519  hitchhiker  0.00068952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2914  ferredoxin  53.85 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  52.63 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2800  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2842  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0951997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  47.66 
 
 		 106 aa  97.1  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2520  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2797  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2553  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0617216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2492  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000648223  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2821  ferredoxin  45.79 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000177659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  46.73 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2790  ferredoxin  45.24 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2601  ferredoxin  45.24 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 592 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  27.66 
 
 		 570 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.94 
 
 		 437 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 561 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  32.14 
 
 		 606 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 553 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.38 
 
 		 407 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.43 
 
 		 431 aa  47  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  31.4 
 
 		 434 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  32.5 
 
 		 638 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1417  ferredoxin  38.46 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 589 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  30.53 
 
 		 592 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.24 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  24.71 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 547 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  40.24 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  38.37 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  41.46 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  35.8 
 
 		 652 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1587  ferredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.613502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.18 
 
 		 410 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  39.51 
 
 		 618 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  22.62 
 
 		 408 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  37.8 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  37.8 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.88 
 
 		 407 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.11 
 
 		 605 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  33.33 
 
 		 611 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  36.71 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 574 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.06 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  35.63 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.41 
 
 		 407 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.41 
 
 		 407 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1365  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.34 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.24 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5894  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.44 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313764  normal  0.9402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4900  hypothetical protein  33.67 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  22.78 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.39 
 
 		 411 aa  40.8  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.39 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4450  hypothetical protein  32.18 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  33.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3263  hypothetical protein  31.46 
 
 		 312 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  31.9 
 
 		 614 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.24 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  31.82 
 
 		 610 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  30.38 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.77 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1661  ferredoxin, 2Fe-2S type  31.91 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.799662  hitchhiker  0.000531904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1482  putative ferredoxin, 2Fe-2S type  31.91 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  36.36 
 
 		 113 aa  40  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>